В статье рассматривается критически важный аспект современного биоинформатического ИИ — интерпретируемость и объяснимость белковых языковых моделей (Protein Language Models, PLMs). Авторы Ханклингер и Ферруз представляют комплексный обзор существующих методов объяснимого искусственного интеллекта (XAI), адаптированных для анализа аминокислотных последовательностей. Исследование фокусируется на том, как механизмы внимания и градиентные методы позволяют понять, какие именно паттерны в последовательностях белков определяют их структурные и функциональные свойства. Работа подчеркивает переход от моделей «черного ящика» к прозрачным системам, что необходимо для безопасного внедрения ИИ в процесс разработки лекарств и дизайна белков. Основное внимание уделяется методологиям, которые связывают предсказания нейросетей с биологически значимыми концепциями, такими как вторичная структура и сайты связывания. Данный обзор служит фундаментальной базой для исследователей, стремящихся объединить глубокое обучение с классической молекулярной биологией.