В исследовании представлен TwinSAR (Stoichiometric Analysis and Retrieval) — новый алгоритм для поиска химических «двойников» на основе глобального элементного состава молекул, что является альтернативой традиционным топологическим фингерпринтам. Авторы решают проблему ограничений индекса Танимото, который часто не справляется с поиском биоизостеров (scaffold-hopping). Методология TwinSAR включает три инновации: бинарную блокировку фингерпринтов для ускорения поиска в масштабах миллиардов молекул, адаптивное RBF-ядро с калибровкой через медианную эвристику и фильтр Z-score с логарифмическим преобразованием лоджитов для статистической оценки сходства. Результаты тестов показали, что обнаруженные пары молекул в 12,7 раза более схожи по соотношению элементов, чем случайные пары (p < 0.001). При использовании 8-элементного представления алгоритм работает в 3,55 раза быстрее, сохраняя чувствительность полномасштабной 254-элементной модели. В качестве практического применения алгоритм был протестирован на библиотеке из 327 071 соединения для мишени белка BCL-2, что позволило эффективно сократить выборку до 390 перспективных кандидатов.