Исследователи представили minkiPy — новый геометрический фреймворк на языке Python, предназначенный для анализа пространственной транскриптомики. Библиотека позволяет вычислять компактные профили морфологических и топологических дескрипторов для каждого гена на основе функционалов и тензоров Минковского. Это решает критическую проблему сравнения паттернов экспрессии генов внутри одного образца и между различными условиями. Методология позволяет ранжировать гены по степени их пространственной реорганизации, создавая единое пространство признаков для анализа. В ходе тестирования minkiPy был применен к набору данных MERFISH для культур миобластов при лицелопатно-плечевой мышечной дистрофии, а также к данным Visium HD для сравнения тканей колоректального рака и прилегающих здоровых тканей. Инструмент является open-source решением и может значительно ускорить интерпретацию сложных пространственных данных в биомедицинских исследованиях.