Представлен метод PixAQ, предназначенный для улучшения количественной оценки белков на уровне отдельных клеток при использовании микроскопии масс-цитометрии (IMC). Традиционные подходы часто суммируют сигналы всех маркеров в пределах одной маски клетки, что приводит к ошибкам из-за перекрытия сигналов соседних клеток или игнорирования пространственного распределения. PixAQ решает эту проблему, применяя вероятностное присвоение пикселей на основе маркера, комбинируя данные о пространственной близости и интенсивности сигнала с явным остаточным компонентом. Метод позволяет точно определить, какие локальные сигналы вносят вклад в измерение каждого конкретного маркера, не изменяя саму сегментацию клеток. Валидация проводилась на трех когортах, охватывающих 680 областей и 366 пациентов. Результаты показали улучшение согласованности с заранее определенными соотношениями маркеров популяции: медианный прирост ожидаемой доли маркера на пациента составил от 1.99 до 4.83 процентных пунктов по сравнению с традиционным методом общих масок. Анализ аблиации подтвердил, что как пространственные, так и интенсивностные данные вносят равный вклад в повышение точности. Метод применим как к обычным, так и к высокодетализированным изображениям IMC, открывая новые возможности для точного анализа клеточной микросреды.