В статье представлен PocketScope — новый вычислительный фреймворк для поиска сайтов связывания лигандов в протеоме человека без необходимости обучения. Метод использует замороженные эмбеддинги белковой языковой модели ESM-C 600M для представления аминокислотных остатков, выстилающих полости белков, и выполняет исчерпывающий поиск по принципу позднего взаимодействия MaxSim, избегая пулинга и приближенного поиска ближайших соседей. С помощью PocketScope авторы идентифицировали 153 805 полостей в 37 682 белках человеческого протеома AlphaFold и успешно восстановили задокументированные офф-таргеты лекарственных препаратов на наборе фармакологических пар. На бенчмарке ProSPECCTs метод занял первое место среди 23 методов по среднему рангу в десяти коллекциях. PocketScope представляет собой практичный инструмент для предсказания офф-таргетов в масштабе всего протеома, что важно для оценки безопасности лекарств и понимания механизмов их действия. Фреймворк доступен как открытый исходный код и веб-сервер.