В статье представлен OmegAMP — генеративная модель на основе условной диффузии для дизайна антимикробных пептидов (АМП). Модель позволяет контролировать чистый заряд, среднюю гидрофобность и длину последовательности, поддерживая три режима: создание новых пептидов de novo, генерацию аналогов и дизайн с заданными мотивами. В ходе экспериментов на 204 пептидах, охарактеризованных в мокрых лабораторных условиях, генерация de novo позволила получить антимикробные соединения с широкой активностью против клинических изолятов грамотрицательных бактерий с множественной лекарственной устойчивостью. Генерация аналогов превратила шесть неактивных прототипов в активные антимикробные пептиды, при этом механизм разрушения мембраны и безопасность для клеток млекопитающих определялись исходным прототипом. Мотив-управляемая генерация аналогов сохраняла связывание липополисахарида у активных прототипов, а редизайн неактивной лейциновой молнии придал ей антимикробную активность, сохранив способность нарушать ДНК in vitro. В моделях инфекций на мышах (кожа и бедро) лидирующие кандидаты снижали бактериальную нагрузку, причем один из мотив-управляемых кандидатов, нарушающих ДНК, системно соответствовал контролю с фторхинолоном. OmegAMP открывает программируемый путь к новым пептидным антибиотикам, чей механизм действия и безопасность следуют из выбранного прототипа.